köye yerleşen ilk insanların koyun besledikleri için bu adı aldığı sanılmaktadır. Sakarya Nehri'ni geçerek bu bölgeye ilk yerleşen Koyun Baba isimli büyüktür. Zamanla Koyunlu Köyü oluşmuştur. Köy İpek Yolu üzerindedir. Frig,Roma ve Bizans kalıntıları mevcuttur. Sakarya Nehri üzerine kurulmuş iki eski taş köprü kalıntısı mevcuttur. Köyün yamacına kurulmuş olduğu kayalar Osmanlı zamanında eşkıyaların yatağı olmuştur. Kervanları yağmaladıkları söylenmektedir. Kurtuluş Savaşı esnasında Yunan askerleri Sakarya Nehri'ni geçemedikleri için köyü uzaktan top ateşine tutmuşlardır.